1999年(nián )，某个东西被卡(kǎ )车(chē )(📒)运出了馆山市。几天(🕟)后，哥斯拉登陆了馆(guǎn )山，特生自(zì )卫(wèi )队出动与之展开了苦战。在(zài )战斗中，自卫队员(yuán )家城茜（釈由(🐿)美子 饰）意外害(🎡)死了(le )战友叶山二尉（森(sēn )末慎二(èr ) 饰）(📞)，自己却侥(yáo )幸活(huó )了下来，并被派(🥀)去(qù )了资料科。　　(⏺)另一(yī )方面(miàn )，日本政府在柘(zhè )(🛑)植真智(zhì )(🖲)子首(shǒu )相（水野(yě )久美 饰(🥔)）(💻)的指(zhǐ )挥下(xià )，召集了汤(tāng )原德光（宅麻(má )伸 饰(⛓)）(🎾)等科学家开始(🤷)研究(🧤)对付哥斯拉的(😍)G兵器(⛳)。他们以在馆山冲挖(wā )掘出来的初代(🗳)哥(gē )(🤘)斯拉骨(💝)骼为基础，用(👊)了四年制成了机械哥(gē )斯拉(🌹)—(⛏)—3式机龙。柘植首相(xiàng )辞职，由(😝)科(🔈)学技(🙎)术厅长官五十岚隼人（中尾(wěi )(🔤)彬 饰）(🥤)就(jiù )任新首相。同时，茜(qiàn )被派去(qù )了机龙队，担(dān )(🆙)任(🖍)机龙的操作(🌸)员。　　就在准(🔲)备机龙测(👗)试(shì )机动时(🍺)，哥斯拉(lā )(🛃)又在东(dōng )京湾出(❓)现了。机龙赶赴现场(🍹)与哥斯拉对战(⏺)，却因哥(🈳)斯拉的吼声唤(huàn )醒了体(tǐ )内的野(💛)兽灵魂，突(🏡)然暴走，在城(🛌)市中造成了大(dà )破(♊)坏(huài )。　(🏗)　为了(le )改(gǎi )良(liáng )机龙，汤原改变(biàn )了(🕌)机(jī )龙DNA计(♟)算机(🦐)的碱构(gòu )造，使机龙不会再受(shòu )哥(gē )(👡)斯拉叫声(shēng )的干扰。但(🌽)由于对再次暴走的(🔰)担(dān )忧，五十(🍐)岚迟(🧔)迟不允许出(😓)动机龙。　　哥(gē )斯拉(🏫)再(zài )(😛)度出现在(zài )(🍏)东(➿)京(🤙)湾，一路无视特生自卫队的攻击来(🆕)到(dào )了(le )品川，令城市变(biàn )成了一片(piàn )火海。面对如此(🥘)情景，五(wǔ )十(🤖)岚(♿)终于同(tóng )意(🥡)让(ràng )机龙出动。　(🚬)　为(wéi )了打败哥斯拉(lā )，机龙被(☔)送到了品(🚄)川(chuān )。茜(qiàn )也抱着必死的(de )觉悟。机龙和茜的(de )(🗄)战斗就(🎅)这样开始(🐁)了(🏚)。