继续延(yán )续上(⛲)一季的剧情，原来(lái )穆(🔼)德受(shòu )了(le )骗，及时发觉错误(🤴)后和史(🔧)考莉串通(🥈)好来骗(🌰)政府(🔬)高层，以潜入(rù )一个“作为(⏬)一个普(❣)通FBI特别探(tàn )员不(bú )该进入的(🎩)地方”搜(sōu )(🎡)集需要的资(zī )料。本季(🛹)发展越来越(yuè )精彩(📞)，一些(🥞)没有被(bèi )完全(quán )改造的(de )混血外星人联(lián )合起(qǐ )来抵(dǐ )(💞)抗殖(🚢)民(🌙)阴谋。史考(kǎo )莉被绑架时(shí )子宫被移除，但今年(nián )却出(chū )现了她的孩子(zǐ )(🔝)——艾(ài )蜜莉。今年制(㊙)作小组甚至找(zhǎo )(🎾)了两位(wèi )知(⛏)名科幻小说家(jiā )操笔，客串(💠)写出(⛳)两集剧本。另外今(🚴)年也有一集喜剧。整出X档案为了(🥊)配合电影(yǐng )的(de )上映，加入了(🏻)一些(xiē )(🌹)角(jiǎo )色及内(nèi )容，“辛迪(🌼)加(jiā )”组织的阴谋越来(🙎)越明显，穆德再一次接近(📛)事实的真相。穆德前女友的(🍽)出现(🔞)也(yě )对穆德(🔎)与(🌂)史考莉(👄)间的(de )(🆙)关系做(💣)出重大(🌸)考验(yàn )。该季结束于吸烟(😳)人烧毁了所有X档案卷宗。