自西元(🍅)20XX年，人类从肯亚(yà )图尔卡纳湖(hú )的(🕋)湖畔挖出(chū )了一个(gè )(🤢)名叫(🍥)索哈尔(Zohar)的物体(tǐ )之(🐮)后，便开始(shǐ )对它进行(🎲)研(yán )究，后(hòu )来有人重建出(chū )来(lái )所谓的“神之语(yǔ )言”，并建立(lì )电脑程式以(🚉)启动原始索(🛺)哈尔，进行和上位领域的U-DO(上位领(lǐng )域(yù )当中的红色(sè )波动存在)连结的连结实(😞)验(🖲)，但很不幸地，从(㊗)上位领(lǐng )域(yù )流(liú )(🙂)入下位领域的能量(liàng )造成了(le )(㊙)事象(xiàng )变移，使(shǐ )地球(🈴)(游戏(xì )中(🤷)所谓的“失(shī )落耶(yē )路(😍)撒冷”)几乎完从从宇宙中(🧣)“消失(shī )”，人(🗳)类因而被(bèi )迫逃亡，离开地(🛎)球。　(🐾)　到了四千(🏻)年多后，在(zài )故事(🤷)开(🃏)始前(💅)十五的(💹)T.C.4753年，米尔奇亚(yà )行(háng )星(Miltia)爆发了所谓(🐞)的(de )(🍽)米尔(ěr )奇(qí )亚冲(chōng )突事件，在(zài )此次事件当(💣)中(zhōng )，米(🌸)尔奇亚(🏓)行星的人(🔲)类疑(🕕)似遭到了格诺西(🔪)斯(Gnosis)的攻击，并在(😉)冲(chōng )突(tū )事件(⛴)后(hòu )消失(shī )，但(dàn )事(shì )件的真相却(🔬)因为(wéi )米尔奇亚的消(xiāo )(🐱)失而(💛)不为人知。在事件后，启动原(🕵)始索哈尔（(♊)后来人类(🍉)制造(zào )出了(🌒)十二(èr )具索哈(hā )尔模拟体(tǐ )，因此(cǐ )原有的索哈尔就(jiù )被称之为原始索哈尔）(👡)所需(🐼)的神之(🥈)语言、原(yuán )始(shǐ )索哈(🎇)尔的研(🦄)究成(chéng )(🔰)果、(🏉)米尔奇亚的U.M.N.座(🏓)标等事物，都被(bèi )封存在Y资料当中，而Y资(zī )料又被封(fēng )存在百(🔭)式观测(cè )用合成人(🛒)(Relian)M.O.M.O.的意(yì )识内，然而这么做(zuò )却(què )引起了各(gè )方势力(lì )对(📻)M.O.M.O.的争夺(📧)，因此星团联邦(bāng )政府(📒)(游戏中(📦)统治各行星(xīng )的政府，英文(🚰)名(míng )Galaxy Federation)雇了一(yī )(👌)个(gè )名叫(🏰)Ziggurat 8的生(🏃)化人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的(de )安全。　　另(🥖)一方面，在米(🕎)尔(👑)奇(qí )亚(yà )冲突事件(🥩)结(🚌)束后(🦋)的十几年，也就是大约在游戏EPI开(👮)始(💽)的时候，当时最大的企(qǐ )业贝克达公司以对(🖼)抗格诺西斯侵(qīn )(🥑)扰(rǎo )(📏)的名义，进行(🥤)对格(📐)诺西斯用(yòng )战斗(dòu )兵(bīng )器KOS-MOS的开发计(🔹)划，但和当时(shí )(🕰)多使(🏟)用合(hé )成人(Relian)与(📢)生化(😾)人(📰)(Cyborg)的情况所不同的是，KOS-MOS是个(gè )纯(🔪)粹的机械制品。另一方面(🤣)，在EPI开始时，参(cān )与KOS-MOS开发计划的(de )贝(bèi )克达(dá )公司(sī )第一开(kāi )发局研(🔼)究人员卯月紫(🕤)苑(yuàn )，正(zhèng )(📼)乘着当时载有(🤱)还没(🧀)正式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行(💍)旅途(tú )(🖱)。但(dàn )(♟)没想到其太空(📛)船却(🏺)被(bèi )冲(📔)著索哈尔而来(lái )的格诺西(🏗)斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启(qǐ )动，卯(mǎo )月(🏆)紫苑(yuàn )因而(📲)被卷入(🤕)一(yī )连串和格(gé )诺西斯(sī )及索哈(hā )尔有关(⏺)的阴谋，以及会改(🌓)变(biàn )(🌂)人类(lèi )命运的(de )事件(jiàn )当中……