自西元20XX年(⛲)，人类(🥇)从(cóng )肯亚图尔卡(🔼)纳湖的湖畔(🕟)挖(🕸)出(chū )(🛍)了一(yī )个名(míng )叫(🍥)索哈(hā )尔(🎗)(Zohar)的物体之后，便开(kāi )始(📿)对它进行(háng )(🎲)研究，后来(♑)有(yǒu )人重建出来(🐿)所谓(🔸)的“神(shén )之语言(yán )”，并(bìng )建立电脑程式以启动原始索哈(hā )尔，进行(háng )和上位(wèi )领域(yù )(😻)的U-DO(上位(wèi )领(🐖)域当(dāng )中的红色(🌙)波动(🧚)存在)连(lián )(🌚)结的连结实验(🖲)，但很(hěn )(💱)不(🦗)幸地(dì )，从上(🥎)位(wèi )(🥔)领域(yù )流入下位领域(yù )的能量(🤸)造(zào )成(chéng )了(le )事象变(🙉)移(💪)，使地(dì )球(游戏中(zhōng )所谓的“失(🤲)落耶路撒(sā )冷”)几乎(hū )完从从宇(🧟)宙中(🧣)“消失”，人类(🤘)因而(ér )被迫逃亡，离开地球。　　到了四千(qiān )年(nián )多后，在故事开始前(qián )十五的T.C.4753年，米尔奇亚(🔍)行(háng )(😙)星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚(🚲)冲(chōng )突事(🌂)件，在此(cǐ )次事件当中(zhōng )，米尔奇亚行星的人类疑似(😳)遭到了(📤)格诺西斯(Gnosis)的攻击，并在冲(chōng )(🚤)突事件后消失，但事件的(de )真(zhēn )相(xiàng )却因(yīn )为米(🌲)尔奇亚的消失(🖱)而不(bú )(👼)为人知。在事件(jiàn )后，启动原(🕵)始(shǐ )索哈尔（后来人(🏗)类制(zhì )造出了十二(🎆)具索哈(🍝)尔(ěr )模拟(nǐ )体，因此原有(yǒu )的(de )索(🦐)哈尔就被称之为(wéi )(😄)原始(shǐ )(🐑)索(🖥)哈尔）所需的神之语(🖥)言、原始索哈尔的研究成果(🍂)、米尔奇亚(yà )的(🧔)U.M.N.座(zuò )标等事物(🃏)，都被(🏫)封存在(zài )Y资料(➿)当中，而Y资料又被封存在百式(shì )观测(🆕)用合成人(Relian)M.O.M.O.的(de )意识内(👉)，然而这么做却引(yǐn )起了各方势力对M.O.M.O.的争夺(duó )(📧)，因此星团联邦政府(游戏(🙎)中(📦)统治(🎁)各行星的政府，英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫(jiào )Ziggurat 8的生化(🚇)人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的(📑)安全(🔝)。　　另一方(🐩)面，在(☕)米尔(ěr )奇亚冲突事件结束后的(de )十(shí )几年，也就(👚)是大约在游(yóu )戏(🐺)EPI开始(shǐ )的时候，当(dāng )时(shí )最大的企业(yè )贝(bèi )克达公司以对抗格(gé )诺西(xī )(🧢)斯侵扰的名(míng )(🔵)义，进(✉)行对格诺西斯用战(🙈)斗(dòu )兵器KOS-MOS的开发计(🔹)划，但和(hé )当(dāng )时多使(🏟)用合成人(Relian)与(yǔ )(📢)生化人(Cyborg)的情况(🗣)所不(bú )同的是，KOS-MOS是个纯粹的(🔢)机械(🍺)制(zhì )品。另一方面(🤣)，在EPI开始(♑)时，参(cān )与(🏉)KOS-MOS开(🐢)发计划(🚱)的贝克达(📃)公司第一开(〰)发(fā )局(👺)研(yán )究人员卯(🚃)月紫苑(😫)，正(zhèng )(📼)乘着当时载有还没正式启动的KOS-MOS的(de )Woglinde号太空船进行(💍)旅途。但没(méi )想(xiǎng )到其太空(kōng )船却被冲(chōng )著索哈尔而来的格诺西斯(sī )所攻(👼)击，而(ér )KOS-MOS也在(🥚)此时(🐉)突(tū )然启动，卯月紫苑因而(📲)被卷入(🤕)一(♌)连(✝)串(chuàn )和格诺西斯及(📈)索哈尔有(yǒu )关的(de )(☔)阴谋，以(yǐ )及会改变人类(lèi )命(🍮)运的事件当中(zhōng )……