自西元20XX年(nián )，人类从肯(kěn )亚(yà )图尔(🍩)卡纳湖的湖畔(🕟)挖出了(le )一个(gè )(🤢)名叫(jiào )索哈(🔧)尔(Zohar)的物体(tǐ )之(zhī )(🐮)后，便开始对它(👋)进行研(🎏)究，后来有(yǒu )(📼)人重建出来所谓的“神之语言”，并建立(💆)电脑程式以(yǐ )(🚉)启动原始索哈尔，进(jìn )(🥞)行(🗑)和上位领域(😻)的(🚸)U-DO(上位领域当中(zhōng )的(⏺)红色波动存在)连(🌚)结的连结实(shí )验，但很(💱)不(bú )幸(xìng )地，从(㊗)上(shàng )(🥎)位领域流入(rù )下位(wèi )领域(yù )的能量(🤸)造成了事象(xiàng )变(🙉)移，使地球(游戏中所谓的“失落耶(yē )路(lù )(😍)撒冷”)几乎完(wán )从从(cóng )宇宙中“消失(shī )”，人类(🤘)因(🈁)而被(bèi )迫逃(táo )亡(wáng )，离开地(dì )球。　　到了(le )(🈸)四千年(🐛)多后，在故事开始前十(🌼)五的T.C.4753年，米尔(ěr )奇亚行星(Miltia)爆发了所(🥅)谓的米尔奇亚(🚲)冲突事(🌂)件，在此次事件当中，米尔奇亚行星的人类疑似遭(zāo )到(🎦)了格诺(🍺)西斯(Gnosis)的攻击，并在(zài )冲(chōng )突事件后(🏸)消(❄)失，但事件的真相却因为米尔奇(qí )亚的消失(shī )(🖱)而不为人知。在(zài )事件后，启动(🍾)原(🕵)始(shǐ )索哈尔（后(👆)来人类(🍉)制造出了十二(🎆)具索哈尔(ěr )模拟体(tǐ )，因此原有的索哈尔(ěr )就被称之为(😄)原始(shǐ )索哈(😂)尔(ěr )）所需(xū )的神(shén )之语(yǔ )言(📸)、(🌲)原始索哈(hā )尔的研(🦄)究成(🔰)果、米(🌸)尔(📳)奇亚的U.M.N.座(🏓)标等事物，都被封存(cún )(🏺)在Y资料当中，而(ér )Y资(🤫)料又被封(💽)存在百(bǎi )式观测用合成人(🛒)(Relian)M.O.M.O.的意识(🚖)内(👉)，然而这(🈲)么做(zuò )却引(🖨)起(🛍)了各方(fāng )势(🚬)力对M.O.M.O.的(de )争夺，因此星(xīng )团联邦政府(fǔ )(游(yóu )戏中(zhōng )统治(zhì )(🎁)各行(háng )星的政(zhèng )府(🌻)，英(yīng )文名Galaxy Federation)雇(🏺)了(😓)一个名叫Ziggurat 8的生化(🚇)人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的(📑)安全。　　另一(✝)方(fāng )(🐩)面，在米尔(ěr )奇(qí )亚冲突事(shì )件结束(shù )后的(de )十几年，也(yě )就(jiù )是大(🎄)约(🤥)在游戏EPI开始的时候，当时最大(dà )的企(🚔)业贝克达公(gōng )司以(👻)对抗格诺西(🧢)斯(sī )侵扰的名(🔵)义(⭕)，进行(🥤)对格诺西斯(sī )用战斗(👵)兵器(qì )(🐆)KOS-MOS的开(kāi )发(🥗)计划(huá )，但和当时(🕰)多使(🏟)用合成人(Relian)与生化(😾)人(Cyborg)的情况所不同的(⚾)是(shì )(✡)，KOS-MOS是个纯粹的机械制(🔰)品。另一方面(🤣)，在EPI开始时(shí )，参与KOS-MOS开(kāi )发计划(🚱)的(de )(🧔)贝克达(dá )(📃)公(gōng )司(sī )(🔛)第(dì )一开发局研究人员卯月(📘)紫苑，正乘着(📿)当时(🥪)载有还没正(🚲)式(shì )启动(🚒)的(de )KOS-MOS的Woglinde号太(tài )空船进行(💍)旅(lǚ )途。但没想到其太(🛵)空船却被冲著索哈尔而来的格诺西(xī )斯所攻击，而KOS-MOS也(yě )在此时突然启动，卯月紫苑因而(ér )被卷(juàn )入一连(lián )串和(🔙)格(gé )诺西(🤯)斯及索(suǒ )哈尔有关的(de )阴(yīn )谋，以及会改变人类(lèi )(🐬)命运的事件(jiàn )当中……